Pour répondre à ses objectifs, COMARGE s'appuie sur un réseau de chercheurs créé au début du projet et qui ne cesse de s'élargir. Le réseau COMARGE permet une meilleur coordination et coopération entre programmes de recherche nationaux ou supra-nationaux, il facilite le partage et l'archivage des données biologiques et environnementales et finalement assure un maximum de synergie entre études des marges continentales.
Le réseau COMARGE compte une centaine de chercheurs, représentant 50 instituts de recherche ou universités et 24 nationalités différentes.